Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTPN13Q12923 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTPN13Q12923 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN13Q12923 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PTPN13Q12923 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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PTPN13Q12923 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PTPN13Q12923 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN13Q12923 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms