Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD47Q08722 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD47Q08722 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD47Q08722 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD47Q08722 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms