Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LRP1Q07954 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms