Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms