Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAX8Q06710 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms