Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OC90Q02509 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OC90Q02509 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OC90Q02509 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OC90Q02509 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OC90Q02509 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OC90Q02509 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms