Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms