Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL20P78556 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL20P78556 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL20P78556 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CCL20P78556 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CCL20P78556 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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CCL20P78556 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CCL20P78556 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL20P78556 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL20P78556 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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