Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACLYP53396 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACLYP53396 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACLYP53396 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACLYP53396 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACLYP53396 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACLYP53396 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACLYP53396 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACLYP53396 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACLYP53396 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACLYP53396 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACLYP53396 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACLYP53396 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACLYP53396 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACLYP53396 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACLYP53396 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACLYP53396 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACLYP53396 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ACLYP53396 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACLYP53396 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACLYP53396 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACLYP53396 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACLYP53396 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACLYP53396 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACLYP53396 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms