Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA2P51531 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms