Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL15A1P39059 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL15A1P39059 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL15A1P39059 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL15A1P39059 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL15A1P39059 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms