Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCL3L1P16619 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms