Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NGFRP08138 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NGFRP08138 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms