Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DYSFO75923 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DYSFO75923 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DYSFO75923 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DYSFO75923 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DYSFO75923 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DYSFO75923 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms