Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SRGAP3O43295 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRGAP3O43295 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms