Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOBPA7XYQ1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms