Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00862A6NCI5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms