Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF330Q9Y3S2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF330Q9Y3S2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms