Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP3Q9Y2W1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms