Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGTPBP1Q9UPW5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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AGTPBP1Q9UPW5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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