Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIMS3Q9UJD0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms