Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms