Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX02

NLRP2, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP2Q9NX02 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP2Q9NX02 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP2Q9NX02 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms