Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG3Q9NT62 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms