Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNNBIP1Q9NSA3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms