Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STRN4Q9NRL3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms