Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL3Q9NQ33 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASCL3Q9NQ33 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms