Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CBR3-AS1-204ENST00000453159 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC131934.1-201ENST00000527799 912 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 ZNF528-AS1-204ENST00000601562 1069 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC131097.1-201ENST00000437438 739 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 LIF-AS1-201ENST00000447565 808 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 LINC01697-204ENST00000458316 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 LIAS-204ENST00000424936 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms