Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MIXL1Q9H2W2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms