Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHARPINQ9H0F6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms