Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP9Q99956 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP9Q99956 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP9Q99956 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP9Q99956 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP9Q99956 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP9Q99956 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP9Q99956 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP9Q99956 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP9Q99956 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP9Q99956 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms