Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMTK3Q96Q04 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms