Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms