Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCC12Q96J65 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms