Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELP4Q96EB1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms