Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MKL1Q969V6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms