Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms