Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHF3Q92576 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms