Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC4Q8WW27 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms