Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIEQ8NEW7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms