Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms