Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms