Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC41PQ6P2S7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms