Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGEF3Q5TH69 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms