Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP170Q5SW79 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms