Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N0

GGTA1P, Inactive N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1PQ4G0N0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGTA1PQ4G0N0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms