Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPROQ16827 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
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PTPROQ16827 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
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PTPROQ16827 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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PTPROQ16827 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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