Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITSN1Q15811 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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