Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
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