Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms